Detección del virus del amarillamiento de la hoja en variedades comerciales y en la colección de progenitores del Subprograma de Mejoramiento Genético de la Caña de Azúcar de la EEAOC en Tucumán, Argentina

Trabajo financiado por Estación Experimental Agroindustrial O. Colombres (EEAOC) y Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET).

Abstract

El amarillamiento de la hoja, causado por el virus del amarillamiento de la caña de azúcar (SCYLV), está distribuido mundialmente en las regiones cañeras; sin embargo, se desconoce su incidencia y distribución en la Argentina. Por ello se plantearon dos grandes objetivos: i) analizar la distribución en el área cañera de Tucumán de SCYLV, caracterizar el virus y determinar la correlación entre la presencia del este y los síntomas de la enfermedad, y ii) evaluar el comportamiento de progenitores del Subprograma de Mejoramiento Genético de la Caña de Azúcar (SMGCA) de la Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (EEAOC) frente al virus, comparando metodologías de diagnóstico. Para cumplir el primer objetivo, se colectaron 146 muestras de hojas de caña de azúcar con y sin síntomas de amarillamiento, de variedades comerciales, clones avanzados en las etapas finales de selección y progenitores del SMGCA de la EEAOC, en la provincia de Tucumán, en 2011 y 2012. El SCYLV se detectó en 26 muestras mediante RT-PCR, todas correspondieron al genotipo BRA-PER del virus. El análisis filogenético del gen de la proteína de la cápside permitió la agrupación de razas y la distinción entre aislados. La correlación entre la presencia del virus y los síntomas de la enfermedad fue positiva, baja, pero estadísticamente significativa. Respecto al segundo objetivo, en 2013, 2015, 2016 y 2017 se tomaron muestras de los progenitores utilizados en el SMGCA y se diagnosticó la presencia de SCYLV mediante técnicas moleculares, empleando dos pares de cebadores, y serológicas. El 75% de los genotipos evaluados resultó libre del virus durante el período de evaluación considerado. Se detectó que la RT-PCR empleando los cebadores SCYLVf1/r1 sería más sensible que con el par YLS111/462 y que el diagnóstico molecular fue más sensible que el diagnóstico serológico.

ABSTRACT

Detection of Sugarcane yellow leaf virus in commercial cultivars and the parental collection of the EEAOC breeding program in Tucumán, Argentina.

Yellow leaf disease, caused by Sugarcane yellow leaf virus (SCYLV), is worldwide spread in sugarcane regions,however; its incidence and distribution in Argentina it’s unclear. The two main aims of this study were to: i) analyse SCYLV distribution in the sugarcane production area in Tucumán, characterize the virus and determine the correlation between virus presence and disease symptoms, and ii) evaluate the behavior of progenitor collection of the Sugarcane Breeding Program (SBP) of the Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (EEAOC) against the virus, using different diagnostic techniques. In 2011 and 2012, 146 sugarcane leaf samples with and without yellowing symptoms were collected in Tucumán Province from commercial varieties, advanced breeding clones at final testing stages of selection and progenitors of the SBP. SCYLV was detected by RT-PCR in 26 samples, all of them corresponding to BRAPER genotype. Phylogenetic analysis of the SCYLV-CP gene allows clustering of strains as well as to distinguish among individual isolates. The correlation between virus detection and disease symptoms was positive and low but statistically significant. Regarding the second goal, samples from parents used in SBP were collected during 2013, 2015, 2016 and 2017 and diagnostic techniques, molecular (RT-PCR) and serological (TBIA) were compared. Seventy five percent of the genotypes remained disease-free throughout the experimental period. Respect to the diagnostic methods, it is concluded that RT-PCR using SCYLVf1/r1 primers would be more sensitive than YLS111/462 pair, and that molecular diagnosis was more sensitive than serologic one.