La RT-PCR como metodología para el diagnóstico del viroide del enanismo de los cítricos y del viroide de la curvatura de la hoja de los cítricos en el Noroeste Argentino

Resumen

          Los cítricos son hospederos naturales de varias especies de viroides. En Argentina hasta 2022 solamente estaban reportados el Citrus Exocortis Viroid (CEVd) y el Hop Stunt Citrus Viroid (HSVd), agentes causales de la Exocortis y de la Caquexia respectivamente. En razón de que la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR) es una técnica sensible, fiable, económica y de amplia utilización para la detección de diferentes agentes patógenos e implementada en centros de saneamiento cítrico referentes a nivel mundial, el objetivo de este trabajo fue la optimización e incorporación de esta metodología como técnica de rutina del laboratorio para la detección de ambos viroides. A través de un proceso de ajuste se optimizó el protocolo de RT-PCR para la identificación de los viroides causantes del enanismo de los cítricos, el Citrus Dwarfing Viroid (CDVd) y la curvatura de la hoja de los cítricos, Citrus Bent Leaf Viroid (CBLVd). La metodología optimizada demostró ser eficaz para la detección de ambos viroides en diversas especies cítricas, tanto en variedades copa como en portainjertos de quintas cítricas del noroeste argentino, lo que valida su implementación como herramienta de diagnóstico de rutina en el laboratorio del Centro de Saneamiento de Citrus (CSC).

ABSTRACT

Incorporation of RT-PCR as a methodology for diagnosis of Citrus Bent Leaf Viroid and Citrus Dwarfing Viroid

          Citrus trees are natural hosts to several viroid species. Until 2022, only Citrus Exocortis Viroid (CEVd) and Hop Stunt Viroid (HSVd), the causal agents of Exocortis and Cachexia, respectively, had been reported in Argentina. Given the sensitivity, reliability, cost-effectiveness, and widespread use of reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) for pathogen detection, the aim of this work was to optimize and establish this methodology as a routine laboratory technique for the detection of these viroids. In this study, the RT-PCR protocol was optimized for the detection and identification of Citrus Dwarfing Viroid (CDVd) and Citrus Bent Leaf Viroid (CBLVd). The methodology proved to be effective for detecting both viroids in various citrus species, including both scions and rootstocks from citrus orchards in the northwest of Argentina, thus validating its implementation as a routine diagnostic tool in the CSC laboratory.